Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NGFRP08138 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms