Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TOP3BO95985 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms