Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR3BO95264 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms