Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3DO95025 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms