Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN7O94888 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms