Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCATO75600 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCATO75600 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCATO75600 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms