Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms