Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG13O75143 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG13O75143 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG13O75143 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms