Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPAN2O60636 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN2O60636 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms