Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms