Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB3O43889 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB3O43889 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms