Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STX6O43752 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX6O43752 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX6O43752 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX6O43752 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX6O43752 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STX6O43752 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STX6O43752 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms