Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFS4O43181 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms