Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM6AO15550 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms