Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VGFO15240 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VGFO15240 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VGFO15240 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VGFO15240 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VGFO15240 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VGFO15240 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VGFO15240 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VGFO15240 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VGFO15240 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VGFO15240 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VGFO15240 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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