Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP290O15078 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP290O15078 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP290O15078 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP290O15078 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP290O15078 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CEP290O15078 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CEP290O15078 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CEP290O15078 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CEP290O15078 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP290O15078 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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