Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRPO00591 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRPO00591 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRPO00591 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms