Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD1B0YJ81 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms