Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC4A6NH21 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms