Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PALM3A6NDB9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms