Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WUJ7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms