Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms