Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms