Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AUP1Q9Y679 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms