Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms