Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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