Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL4Q9UJQ4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms