Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms