Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms