Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms