Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms