Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms