Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms