Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms