Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC4Q9NTJ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms