Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms