Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPJQ9HC77 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms