Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms