Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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