Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms