Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRACR2AQ9BSW2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRACR2AQ9BSW2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms