Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM79Q9BSE2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms