Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms