Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USB1Q9BQ65 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms