Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms