Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms