Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms