Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms