Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRRC1Q96M27 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms