Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms